Perdonar por no haber respondido antes, estaba vago...
Después de estar estos días con rtorrent, llegué a esto:
Rtorrent + rutorrent es mucho mas complejo que Transmission, eso sin dudarlo... Hay un montón de cosas que puedes hacer....
Sin embargo, no es suficiente para arreglar la sobrecarga. Al igual que Transmission, rtorrent se vuelve inaccesible tras iniciar una descarga. Esto permanece así hasta que acaba la descarga. Aunque he de admitir que en ambas situaciones, con rtorrent se consume menos bus de datos en el hdd...
Por otro lado, no he encontrado la forma de elegir una ruta de descarga para cada torrent antes de iniciarlo (cómodo si hay un archivo que no quieres que se descarguen donde el resto).
Recomiendo rtorrent para quien necesite máxima libertad con los torrents, ya que puedes hacer muchísimas cosas mas que con Transmission.
Dicho esto, me quedo con Transmission porque:
Ambos petan, me es indiferente cual usar de los dos.
Transmission tiene una cómoda interfaz móvil y (en mi caso), notificaciones por whatsapp con mas variables de entorno que rtorrent
Salu2