Hola,
Como ya sabreis tengo un disco duro conectado por usb a mi hg553, so detalo mi experiencia con las distintas particiones:
Empece con NTFS, con un rendimiento muy precario, no iba fino ni el tranmision, tenia muchas bajadas de velocidad y oscilaciones,quedando cada 2 segundos a cero.
Al poco me pase a ext3, con lo que el rendiento mejoro, transmision iba mas fino, aun asi manteniendo ls oscilaciones, pero sin caer a cero, oscilaba entre 500 - 200, pero me causo una corrupcion en unos 10 dias de uso.
Desde unos días he cambiado la unidad a ext4 (sin formatearla) y el resultado ha sido asombroso, la velocidad en transmision es constante y el rendimiento por FTP es mayor.
Tenerlo en cuenta cuando pongais vuestras uniades.