Traigo buenas noticias.

He conseguido desentramar el royo de las wx ...
hay 4 updaters dependientes de wxwidgets , ya sea la parte en python o en gtk.
wxsvg -->> a este le da igual ..compila con las dos
wxHexeEditor -->> a este tambien le da igual compila con las dos
audacity -->> este solo con wxpython 2.8
filezilla -->> las versiones nuevas con wxGTK3
Bien , ...se puede tener en el sistema a la vez wxpython2 y wxgtk3 , por que no comparten librerias son todas distintas , solo se pelean por el fichero
/usr/bin/wx-config
es un simbolico que apunta hacia version 2 o 3 ...asi que segun lo que necesitemos el updater cambiara hacia donde apuntar el wx-config

filezilla ,le cambie la dependencia en vez de wxpython , ahora buscara wxgtk3 y si wx-config no apunta hacia version 3 ..lo cambiara el solito ... lo mismo hace audacity que busca la version 2 , si no apunta , lo cambia el solo tambien.
# Se requiere version 3 de wxgtk se verifica
WXCONFIG=`ls -l /usr/bin/wx-config|cut -d'>' -f2 | sed "s/ //g" |rev|cut -d "/" -f1 |rev`
if [ ! $WXCONFIG = "gtk3-unicode-3.0" ]; then
ln -sf /usr/lib/wx/config/gtk3-unicode-3.0 /usr/bin/wx-config
fi