En una máquina no muy vieja, el rendimiento no es que se note demasiada pérdida con wubi, si tienes un portatil y te interesa la hibernación, si utilizas wubi no podrás hacerlo. Wubi es, en teoría más cómodo para instalar y desinstalar, pero si tienes una partición por ahí de unos 10 gb para probar te llega de sobra, si utilizas windows vista puedes redimensionar el disco desde el propio gestor, y si no con partition magic o cualquier otro lo puedes hacer. Yo haría una partición aparte, eso sí mira antes como desinstalar luego ubuntu, es decir, como volver a poner el mbr como estaba, en windows vista es sencillo con la orden bootrec. En windows xp creo que es fixboot y fixmbr. Un apunte, con wubi, creo que no vas a tener ext4.
Saludos!
