Transmission es lo mas facil, porque instalas el paquete que te crea el gestor gráfico vía web y ya te lo configura todo (bueno, tendrias que cambiarle algunos parametros si quieres como ponerle contraseña y demas, pero hay un paquete que hasta te permite configurarlo via LuCI).
En cambio transmission parece dar ciertos problemas de rendimiento, lo he comprobado y mucha gente de aqui estará de acuerdo. rtorrent+rutorrent es otra opcion pero tienes que instalarlo (tienes por aqui una guia muy completa sobre el asunto, y lo mismo para el mldonkey o como se llame)