Puede ser que el "apagon" sea "fisico" y no solo "virtual".
a mi me suena mas lógico lo contrario, el adaptador integrado suele estar conectado a un bus miniPCI o miniPCIe y eso a nivel hardware es un elemento totalmente distinto a los buses USB, seria muy raro que al inhabilitar un puerto PCI también se tumbaran los USB, pienso que debe ser algo de software, quizás a nivel BIOS.
solo es una opinión, no se si es correcta o no.
lo que si he visto son portátiles en que los adaptadores integrados constan como dispositivos USB si se mira en el administrador de dispositivos o con soft tipo aida64, en mi Aspire One era así.
un saludo