A mí me pasó algo parecido, verás, quería probar Wifislax 4.10 y cuando lo booteaba el USB me saltaba que no contenía ningún S.O. Y era que anteriormente instalé Wifislax 4.9 y tenía que hacer la copia (la primera instalación pide instalarlo en alguna partición y yo elegí la de recovery de Windows) pues luego a darle ruta a esa partición, eliminé los archivos, bin, etc, y otro más que era del WS. Y ya después me salió todo bien.
En tu caso pasará igual? Mira si tienes algún "resto" de Wifislax en algunos de los discos duros.
