Si no los recuperas, prueba con un formato de bajo nivel.
Desde windows con la herramienta HDD LLF Low Level Format Tool de hddguru, una vez formateado a bajo nivel crea una partición en fat32 o ntfs.
Desde Linux
Localiza la unidad del usb
# fdisk -l
Borra el contenido del usb llenandolo de ceros ( si el dispositivo fuese sdb1)
# dd if=/dev/zero of=/dev/sdb
Con gparter, crear una nueva tabla ms2, y una partición nueva del formato que se quiera.
Corregido: borrando usb con varias particiones.
Salu2