De vez en cuando está bien hacer revisiones en los discos, limpiar archivos temporales, vaciar la papelera de reciclaje, los paquetes que hayas podido descargar y que se almacenan en /var/cache/apt/archive pues si ya los tienes instalados lo unico que hacen es ocupar espacio, esto lo puedes configurar para que se vaya borrando siempre que acabes instalaciones, notarás que ocupa bastante espacio.
Saludos
