No estoy muy puesto en el tema... pero para que estás en la misma red del router principal?, es decir, ponte en otra red el router cliente y ya los "clientes" de router 1 y 2 estarían separados (sino me equivoco claro).
Resumiendo:
Router principal: 192.168.1.1
Router en modo cliente: 192.168.2.1 (esta sería la lan) la wan sería la 192.168.1.180 (por ejemplo).
Los clientes del router principal estarían en: 192.168.1.x (los recursos compartidos de estos se verían entre ellos, pero no los de 2.x) y viceversa.
Los clientes del router cliente estarían en: 192.168.2.x
Si me equivoco pues me avisaís, que estoy empezando en esto de la informática y redes y ando aún leyendo
Un saludito!