Hola, yo no tengo un gestor de descargas gráfico, pero tengo dd-wrt y optware instalados en un router con USB y un disco duro puesto, y lo puedo hacer desde la línea de comandos accediendo por ssh, con wget, por ejemplo:
nohup wget -c
http://archivo/a/descargar &
y para monitorear la descarga:
tail -f nohup.out
nohup es para que podáis desconectaros del router y el proceso no se detenga.
Funciona con megaupload, simplemente esperad a que pasen los 45 segundos para comenzar a descargar, y en vez de darle al botón de descargar, con el botón derecho del ratón copian el link y lo pegan tal cual como argumento del wget -c
Saludos