que distribucion usas ?, describeme un poco mejor la situacion ..
en principio como root , como bien dices, no deberias tener problemas.
para tener acceso como root en las live cd , depende de la distribucion , las hay que directamente accedes como root , las hay como el caso de ubuntu Desktop , que has de teclear antes 'sudo' .
lo dicho , describeme un poco mejor el entorno ..
en el caso de tener que cambiar los permisos a un fichero por bloques como es una particion del disco duro , deberas estar logueado como root en todo caso , ya que no es algo trivial , y no puede hacerlo un usuario normal ..
saludos