a veces va bien instalar en un pendrive manualmente una copia simple, sin sistema operativo, de un bootloader como grub2.
desde ese pendrive, cuando a nuestro linux se le muera su gestor de arranque, podremos volverlo a la vida. tambien podremos meter isos de sistemas operativos live en el pendrive, hacer un menu de arranque con las diferentes isos que tengamos, y cargar dichas isos como si fueran cd's de verdad usando las nuevas y potentes funciones de grub2.
en definitiva, que sirve para muchas cosas.
para instalar grub2 en tu pendrive manualmente, asegurate de que está correctamente montado y aplica los siguientes comandos. En los ejemplos se supone que tu pendrive es /dev/sdb y está montado en /media/pendrive. Recuerda hacer los cambios acortes a tu sistema:
grub-install --force --no-floppy --root-directory=/media/USB /dev/sdb
posteriormente debes editar el fichero boot/grub/grub.conf para que arranque los diferentes kernels y/o particiones de tu pc, o incluso como decia antes puedes arrancar isos que estén copiadas en la raiz del mismo pendrive, como ya expliqué en posts anteriores.