digo yo , elimina la partición linux y si no me equboco , con el propio cd de vista te permite reparar la instalación que ya tienes hecha o restaurar el arranque , sinó sin tocar a la otra partición (linux instala desde Vista este programa EasyBCD , con el te deja restablecer el sector de arranque de Vista , luego te cepillas la particion linux a a correr ...
Un saludo