no es difícil, es cuestión de dinero y/o ganas de configurar, contra menos ganas de configurar mas dinero.
lo del pendrive es lo facil, a día de hoy pendrive con tecnología biométrica es muy facil de encontrar y económico, hay pendrive de 8 GB de capacidad con funcion de reconocimiento de huella dactilar por menos de 60 euros.
eso está mejor, por que aunque te roben/pierdas el pendrive, a menos que te corte el dedo no podrán arrancar, eso también está bien por que no es necesario tener que andar todo el dia con el pendrive, lo dejas puesto y cuando quieras arrancar pones el dedo y listo.
también empiezan a haber bien de precio wecams que sirven como reconocimiento facial ,osea te sientas delante, reconocen tu cara y el PC arranca, muy bueno a menos que sea boxeador
como no tengo claro la seguridad que buscas es dificil recomendar sistema, necesito mas datos.
la cosa varia mucho de buscar que no puedan encender un ordenador a que no quieras que otros usuarios autorizados accedan a tus cosas y/o tu cuenta de usuario, como te dediá, necesito mas datos
saludos