uci no es mas que un pequeño ayudante que solo lee las configuraciones en texto plano de /etc/config lo modifica y recarga ciertos demonios al cambiar las configuraciones. Instalado ocupa unos 8 Kb y ademas necesita ciertos programas del paquete base files, que son sobre otros 10 Kb. En total tratar de retirar uci es un ahorro de unos 20 Kb, algo realmente pequeño. Y complicado por que muchos programas llaman a uci.
Luci es innecesario.
Si quieres no usarlo, editas los archivos de configuración de /etc/config a la antigua y listo, es lo que hago yo. Por que llevo tanto tiempo editando las configuraciones en archivos de texto plano que me aturullo con otras cosas.
Ya que mencionas libubox, forma parte del conjunto RPC (remote procedure call) que es el enlace correcto para funciones de programas fronted que es lo que entiendo quieres hacer, en el caso de luci usa lua via json-rpc