A mi me paso lo mismo, siempre iniciaba bien, el dia que quise instalarlo en el hdd no pude por que la partición que había formateado en ext4 no se dejaba montar, lo formateaba varias veces inclusive cambie alguno parámetros no se exactamente cuales, uno que decían boot, raid, palo, etc.
soy noob con esto, pero a mi se me soluciono borrando esa partición y reparando el arranque del disco volviendo al mbr de mi partición Windows.
si lo quieres comprobar , si por casualidad tiene el sata en modo IDE, cámbialo a AHCI, si te inicia wifislax pues tienes mi mismo problema
