no no, los bootinst son simples scripts instaladores, lo que instalan es syslinux, que es el cargador de arranque habitual en estos casos.
por eso, si el cargador de arranque utilizado al final es el mismo (unetbootin no instala grub, que yo sepa!), y si el initrd es el mismo en todos los casos... no queda mucho por donde mirar, salvo añadir más drivers necesarios dentro del initrd, que actualmente no estén en él.