Tu pregunta es más o menos igual que decir "en que se diferencia el touchpad del portatil de un ratón USB.
El segundo, además de conectarse por USB tiene algunas pequeñas diferencias físicas.
En el caso de los adaptadores un adaptador USB, como el que pones, puede conectarse en un equipo sin adaptador, puede permitirte conectar una antena externa, a diferencia de otros como los de la mayoría de los internos de los portatiles, alguna tienen más potencia que otras y aceptan diferentes estándares b/g/n diferences velocidades de trasmisión de datos (entre el adaptador y el router), y por si chipset unas tienen mejor sensibilidad para las redes, les afectan más las interferencias, existen o no drivers que permitan ponerlas en modo monitor, promiscuo o inyectar paquetes.